国内刊号:61-1359/S
国际刊号:1009-1041
发布日期:
作者:王孜逸,李嘉伟,耿梓瀚,倪守飞,丛钰莹,刘浩,赵彦宏,胡德昌,王艳芳
单位:(1.鲁东大学生命科学学院,山东烟台 264025 2. 鲁东大学园艺学院,山东烟台 264025)
关键词:大麦,GATA基因家族,生物信息学,全基因组鉴定,
基金:国家自然科学基金项目(32272159)
GATA基因家族成员是植物重要的转录因子,广泛参与植物生长发育及多种生理生化过程。为了解GATA家族成员在大麦中的分布及其功能,基于生物信息学方法系统开展了大麦GATA基因家族成员的全基因组鉴定及其结构、共线性、启动子、表达模式等分析。结果表明,在大麦基因组中共鉴定出27个GATA基因,依次命名为HvGATA01~HvGATA27,其不均匀分布于7 条染色体上。27个HvGATA基因的内含子数在0~7之间,所有成员均包含典型的GATA保守结构域。通过系统进化分析将27个成员划分为5个亚组(S1~S5),其中S5亚组包含9个成员,S3亚组仅1个成员;不同亚族成员间的内含子和外显子分布存在明显差异,且除S3亚组外,其余亚组成员均在单、双子叶植物分化前已存在。经共线性分析,在大麦与水稻、拟南芥、二穗短柄草、大豆、番茄基因组间均存在共线性GATA基因对,但大麦与水稻、二穗短柄草中的共线性基因对明显多于其余三个物种。通过顺式作用元件分析,大麦GATA启动子区富集有光响应元件及激素信号响应元件。HvGATA基因在大麦16 个不同组织中的表达存在明显差异,多数HvGATA基因在花序中呈现高表达特征,而在去苞片籽粒中表达量较低,暗示其可能参与大麦开花发育调控。
来源:2026年第1期
《麦类作物学报》期刊编辑部