麦类作物学报

作者：姚丽霞，刘丽苹，万广有，王化俊，汪军成，姚立蓉，李葆春，孟亚雄

单位：1.甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州 730070； 2.甘肃农业大学农学院,甘肃兰州 730070；3.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州 730070

关键词：大麦,农艺性状,全基因组关联分析,SNP标记,QTL,

基金：国家大麦青稞产业技术体系项目（CARS-05-03B-03）；国家自然科学基金项目（31960426）；自然科学基金重点项目（24JRRA637）

本研究以240份大麦品种（系）为材料，利用大麦40K SNP芯片进行基因型分析，并通过一年两点对8个农艺性状进行鉴定，基于混合线性模型（mixed linear model, MLM）进行全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）。结果表明,8个主要农艺性状均呈现正态分布。使用Admixture软件对240份大麦品种（系）质控后的基因型进行群体结构分析，240份材料大致分为10个亚群。GWAS共检测到118个分别与株高、穗长、芒长、有效分蘖数、总分蘖数、穗粒数、穗粒重和千粒重显著相关的SNP位点，分布在1H、2H、3H、4H、5H、6H和7H染色体上，其中有6个SNP位点可同时控制两个农艺性状，2个SNP位点可同时控制3个农艺性状。确定了24个与SNP位点对应的QTL，其中控制株高的QTL有2个，穗长QTL有1个，芒长QTL有2个，有效分蘖数QTL有2个，总分蘖数QTL有1个，穗粒数QTL有4个，穗粒重QTL有10个，千粒重QTL有8个。在黄羊和永昌环境点中,稳定的QTL有1个，株高、穗长、有效分蘖数和总分蘖数只在一个环境点存在QTL位点，其余4个农艺性状分布在两个环境点不同的QTL位点中。根据关联分析结果，以显著位点上下游150 kb范围作为置信区间，在1H、2H、3H、4H、5H和6H染色体上共寻找到32个基因，基于前人研究和Blast基因注释共筛选到2个最有可能与大麦的生长发育等方面相关的候选基因。

来源：2025年第6期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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