国内刊号:61-1359/S
国际刊号:1009-1041
发布日期:
作者:王建飞,郭利建,高维东,胡城祯,车卓,陈涛,张沛沛,杨德龙
单位:1. 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃兰州 730070; 2.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州 730070
关键词:小麦,FLA基因家族,表达模式,单倍型分析,SNP标记,千粒重,
基金:甘肃省农业农村厅种业攻关项目(GYGG-2024-2);甘肃省科技重大专项(22ZD6NA009);甘肃省科技厅基础研究创新群体项目(24JRRA633);国家自然科学基金项目(32360518,32260520,32160487);甘肃省高校科研创新平台重点培育项目(2024CXPT-01);中央引导地方科技发展资金项目(23ZYQA0322);甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2022CYZC-44);甘肃省教育厅青年博士支持项目(2024QB-062);省部共建干旱生境作物学国家重点实验室开
类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan-protein, FLA)是一类高度糖基化的蛋白,广泛参与植物生长发育及抗逆境胁迫等途径,但其在小麦中的作用机制尚不清楚。为了解FLA在小麦中的分布及其生物学功能,利用生物信息学手段在全基因组水平鉴定了小麦FLA家族成员并对其进行了系统分析,利用RNA-Seq及qRT-PCR检测TaFLAs基因在不同组织和逆境胁迫中的表达模式,通过单倍型分析候选基因与粒重相关性状的关系。结果表明,在小麦中共鉴定到71个TaFLAs基因,分布在17条染色体上,依次命名为TaFLA1~TaFLA71。71个基因按照亲缘关系被聚类为8个亚族,同一亚族的不同成员间具有相似的基因结构和保守基序,推测其具有相似的功能。通过种内同线性分析,71个TaFLAs基因存在85个片段复制基因对,其中30对为基因间重复,55对为基因内重复;通过种间共线性分析,TaFLAs基因与二穗短柄草的BdFLAs亲缘关系较近。经RNA-Seq及qRT-PCR分析,TaFLAs在不同组织、非生物胁迫中普遍表达,其中TaFLA15、TaFLA34和TaFLA62在穗和籽粒中表达量较高,TaFLA5、TaFLA15、TaFLA34和TaFLA62在PEG 6000处理下上调表达,TaFLA5和TaFLA34在NaCl处理下上调表达。针对TaFLA62开发了SNP分子标记,通过结合地理时空分布进行关联分析,TaFLA62-HapⅡ是增加粒重的优异单倍型,且在小麦育种过程中受到正向选择。综合来看,小麦TaFLAs的基因结构相似,大多数能够响应逆境胁迫,其TaFLA62-HapⅡ单倍体型可用于小麦产量性状的改良。
来源:2025年第10期
《麦类作物学报》期刊编辑部