国内刊号:61-1359/S
国际刊号:1009-1041
发布日期:
作者:王玉杰,顾鹏程,许静玉,胡尚钦,汪军成,姚立蓉,司二静,马小乐,杨轲,张宏,王化俊,李葆春
单位:1.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州 730070; 2.干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州 730070; 3.甘肃农业大学农学院,甘肃兰州 730070
关键词:miR164,小麦,衰老,靶基因,NAC,
基金:国家自然科学基金项目(31960072, 32001514);国家现代农业产业技术体系项目(CARS-05-04B-2);产业支撑计划项目(2021CYZC-12);甘肃省自然基金项目 (20JR10RA507);干旱生境作物学国家重点实验室开放基金项目(GSCS-2021-05, GSCS-2016-3);甘肃农业大学伏羲青年英才计划项目(Ganfx-03Y06);甘肃农业大学国家级大学生创新创业训练计划重点支持领域项目(202110733001);种业攻关和农业科技支撑项目(KJZC-202
miR164是植物中一种重要的非编码RNA,对植物的生长发育具有重要作用。为了解miR164靶基因与小麦衰老的关系,本研究通过在线软件对小麦中miR164家族成员进行了鉴定并对其进行生物信息学和表达分析。结果表明,从小麦中共鉴定出13个miR164家族成员,其不均匀分布在9条染色体上。系统进化分析表明,13个小麦miR164与同属于禾本科单子叶植物的水稻亲缘关系较近。13个Tae-miR164均能形成稳定的二级结构,成熟序列碱基具有高保守性,仅有3个Tae-miR164成员在第21位存在差异,成熟序列产生于前体中具有碱基高保守性的第1~21位。Tae-miR164的靶基因中,有18个为NAC转录因子,占所有靶基因总数的75%,表明Tae-miR164的主要靶基因为NAC转录因子。Tae-miR164家族成员在小麦叶片中的表达量明显高于其他组织;在小麦叶片衰老过程中,与其他Tae-miR164靶基因相比,有3个Tae-miR164靶基因表达差异显著,其ID分别为TraesCS4A02G225100、TraesCS5B02G054800和TraesCS5A02G04910,其中TraesCS5A02G04910为NAC转录因子,推测NAC转录因子与小麦叶片衰老密切相关。比较不同物种中miR164家族成员数量,发现miR164家族成员数量与物种基因组大小和物种亲缘关系无关。
来源:2024年第4期
《麦类作物学报》期刊编辑部