麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2024年第5期:337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析

发布日期:

作者:席甜甜,吴倩,杨建光,马新,陈彦竹,李煜,王军卫,马守才

单位:(西北农林科技大学农学院/小麦育种教育部工程研究中心/陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室,陕西杨凌 712100)

关键词:小麦,全基因组关联分析,籽粒性状,SNP,候选基因,

基金:陕西省重点研发计划项目(2023-YBNY-024;2023-YBNY-021);陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室后补助项目(2018SZS-22);西安市科技计划项目(23NYGG0021);“两链”融合专项“小麦种业创新工程项目”(K3031222158)

小麦籽粒大小和形态是决定产量的主要因素之一,挖掘籽粒相关性状的关联位点,筛选相关候选基因为提高小麦产量奠定了重要基础。本研究以337份小麦品种作为研究对象,利用Q+K混合线性模型(MLM)在3个环境(E1:2020年陕西杨凌;E2:2020年陕西斗口;E3:2021年陕西杨凌)下对小麦的千粒重、粒长、粒宽以及籽粒长宽比4个性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。在3种环境中,不同小麦品种的4个籽粒性状都表现出了广泛的表型差异,变异系数为5.31%~14.76%,其中粒长的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大。GWAS结果表明,49个显著SNP位点至少在2个环境中被检测到,分布在除1B、4A和7D外的染色体上,解释了3.36%~12.73%的表型变异。检测到一因多效位点31个,在5A染色体上检测到3个环境下与3个籽粒性状(千粒重、粒长、粒宽)稳定相关的位点,表型贡献率为3.51%~7.74%。对稳定关联的SNP位点上下游各200 kb的物理区间内进行候选基因挖掘,筛选到5个(TraesCS2B01G225400、TraesCS4D01G016900、TraesCS5A01G454100、TraesCS5B01G459500、TraesCS6B01G064000)可能与小麦籽粒性状相关的基因,分布在2B、4D、5A、5B和6B染色体上。

来源:2024年第5期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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