国内刊号:61-1359/S
国际刊号:1009-1041
发布日期:
作者:郝小聪,王伟伟,汪德州,房兆峰,柳珊,朱文根,逄子剑,张胜全,赵昌平,张风廷,唐益苗
单位:(1.北京市农林科学院杂交小麦所,北京 100097 2.新疆莎车县巴格阿瓦提乡政府,新疆莎车 844715)
关键词:小麦,PHO基因家族,进化系统分析,表达分析,磷转运蛋白,
基金:北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20200423);基因组学育种协同创新中心资助项目(KJCX201907-2)
PHO基因家族主要参与磷酸盐的转运,在植物生长发育中起重要作用。为研究小麦PHO基因家族成员的潜在功能,本研究从小麦全基因组中鉴定PHO基因家族成员,并利用生物信息学手段对其基因结构特征、蛋白结构域、系统进化、顺式作用元件及表达特性进行分析。结果在小麦全基因组中共鉴定到12个PHO基因家族成员,所有成员均含有SPX和EXS结构域。系统进化、保守结构域和基因结构分析发现,小麦PHO蛋白与拟南芥PHO1-H1蛋白以及水稻PHO1蛋白亲缘关系较近;除TaPHO7、TaPHO10、TaPHO11和TaPHO12蛋白缺少部分基序外,其余小麦PHO蛋白均具有完整基序,且同一亚组内的成员具有相似的蛋白保守结构域和基因结构,说明PHO亚家族成员间高度保守。顺式作用元件分析发现,小麦PHO基因启动子区域含有与磷调控相关的激素诱导、光响应、低温响应等元件。基于RNA_seq数据的组织特异性分析发现,大部分PHO基因在根中的表达量较高。qRT-PCR分析发现,低磷胁迫处理下磷高效小麦品种小偃54地下部分(根) TaPHO7和 TaPHO8基因的表达量显著高于对照。
来源:2023年第1期
《麦类作物学报》期刊编辑部