麦类作物学报

作者：杨晟，尹誉蓉，王长彪，任永康，牛瑜琦，韩斌，唐朝晖

单位：1.山西农业大学农学院,山西晋中 030801； 2.山西农业大学生命科学学院,山西太原 030031

关键词：小麦属,山羊草属,e-PCR,SSR分子标记,电子指纹图谱,

基金：山西省重点研发计划项目（201903D211004-2-2）；山西农业大学生物育种工程项目（YZGC092）；山西农业大学学术恢复科研专项（2020xshf06）

电子指纹图谱的绘制可对电泳结果进行规范化、可视化操作，进而提高小麦分子标记的流通性，加速小麦育种进程。本研究用MicroSAtellite (MISA)软件对小麦属、山羊草属共61个叶绿体和13个线粒体的全基因组SSR标记进行搜索，发现SSR位点的出现频率与基因组类型有关，线粒体、叶绿体基因组均以2次重复的五核苷酸和六核苷酸重复基序为主，同一种类型的基序重复次数与SSR数目成反比；基于电子PCR技术 (e-PCR)并结合MapChart软件共筛选出30对引物，其中来源于二倍体和四倍体山羊草属叶绿体全基因组的引物分别有16和2对，来源于四倍体和六倍体小麦属叶绿体全基因组的引物分别有5和2对，来源于六倍体小麦属线粒体全基因组的引物有5对，最后用MapChart软件绘制电子指纹图谱。本研究采用了一种新的SSR引物设计和筛选方法，完成了小麦属、山羊草属叶绿体和线粒体共74个全基因组序列SSR分子标记的初步开发和电子指纹图谱的绘制，为引物开发提供了新思路，有利于提高分子标记的流通性以及小麦种质资源亲缘关系的鉴定。

来源：2023年第5期

《麦类作物学报》期刊编辑部

查看麦类作物学报杂志2023年第5期