国内刊号:61-1359/S
国际刊号:1009-1041
发布日期:
作者:车卓,张沛沛,陈涛,刘媛,马靖福,田甜,王鹏,杨德龙
单位:(1.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州 730070; 2.甘肃省种子总站,甘肃兰州 730070;3.干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃兰州 730070)
关键词:小麦, G6PDH基因家族,全基因组鉴定,表达分析,
基金:甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA828);国家自然科学基金项目(32160487);甘肃高等学校创新基金项目(2021B-125);甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2022CY2C-44);甘肃省农业重点研发计划项目(21YF5NA089)
葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)是磷酸戊糖途径中的关键限速酶,在植物生长发育及非生物胁迫响应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学对小麦 G6PDH基因家族成员进行鉴定,并对该家族基因编码蛋白的理化性质、进化关系、亚细胞定位、基因复制事件以及在不同组织和不同胁迫下的表达模式进行分析。结果表明,在小麦基因组中共鉴定到14个 G6PDH基因家族成员,分布在小麦2A、2B、2D、4A、4B、4D、6A、6B和6D染色体上,其中5个基因编码的蛋白为胞质型,9个为质体型。亚细胞定位预测表明,胞质型G6PDH蛋白主要定位于细胞质上,而质体型G6PDH蛋白主要定位于叶绿体上。根据系统进化和保守结构域特征,可将14个小麦G6PDH蛋白分为Cy、P0、P1和P2四个亚组。共线性分析表明,小麦 G6PDH基因家族成员存在17对片段重复基因。RNA-seq分析结果表明,小麦 G6PDH基因家族成员在不同组织中存在明显的表达差异,其中 TaG6PDH1-2A/2B/2D基因在根中的表达量最高; TaG6PDH2-2A和 TaG6PDH2-2B基因在干旱胁迫后1 h以及热胁迫后6 h均上调表达。进一步利用qRT-PCR检测6个小麦 G6PDH基因在干旱和盐胁迫下的表达模式,发现分别有5个基因在小麦根中均上调表达,推测小麦 G6PDH基因在非生物胁迫响应过程中发挥着重要功能。
来源:2023年第8期
《麦类作物学报》期刊编辑部