麦类作物学报

作者：徐金青，边海燕，王寒冬，王蕾，张波，尤恩，李晓兰，陈文杰，沈裕虎

单位：(1.中国科学院高原适应与进化重点实验室/青海省作物分子育种重点实验室/青藏高原作物种质资源研究与利用实验室,中国科学院西北高原生物研究所,青海西宁 810001 2.中国科学院种子创新研究院,青海西宁 810001 3.中国科学院大学生命科学学院,北京 100049

关键词：燕麦(Avena sativa L.),SNP,品种鉴定,DNA指纹图谱,

基金：第二次青藏高原综合科学考察研究项目（2019QZKK0303）；青海省自然科学基金团队项目(2022-ZJ-902);青海省创新平台建设专项(2022-ZJ-Y04)；中国科学院“西部之光”交叉团队项目-重点实验室合作研究专项

为探究鉴别燕麦品种特异性所需SNP标记的最少数量与鉴别效果，以25个生产上大面积推广的栽培燕麦品种为材料，利用燕麦Illumina Inc.iSelect 6K微珠芯片进行基因分型，按照具有多态性、最小等位基因频率（MAF）大于0.05、缺失率小于0.50的条件进行筛选，获得2 214个高质量的SNP标记。所有SNP标记的平均MAF为0.75，平均多态性信息含量（PIC）为0.28。群体遗传结构分析将25个燕麦品种划分为5个类群。通过去冗余分析，获得8个能够高效鉴别燕麦参试品种的SNP标记。这8个SNP标记的平均MAF为0.62，平均PIC为0.35，表现出丰富的遗传多样性。测序结果显示，所筛选的8个SNP标记具有较好的稳定性和重现性。进一步利用这8个SNP标记构建了25个燕麦栽培品种的SNP指纹图谱，为燕麦栽培品种真实性鉴定和纯度检测提供了可用的标记组合。

来源：2022年第6期

《麦类作物学报》期刊编辑部

查看麦类作物学报杂志2022年第6期