麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2022年第8期:小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析

发布日期:

作者:王谢琴,李瑞雪,张红,陈娇,于小蓉,刘汉梅

单位:四川农业大学生命科学学院,四川雅安 625000

关键词:小麦,淀粉合酶,基因家族,表达差异,顺势作用元件,

基金:国家自然科学基金项目(31601317)

籽粒淀粉的含量和结构影响小麦的产量和品质,而淀粉合酶在淀粉合成中起着关键作用。植物淀粉合酶基因经多次复制和功能分化,形成了具有不同功能特性的多成员大家族。为揭示淀粉合酶基因家族成员间的序列特性和表达差异,本研究参考已知的水稻淀粉合酶蛋白序列,对小麦全基因组中的淀粉合酶基因进行鉴定,并对其进行差异表达分析。结果共鉴定到27个小麦淀粉合酶基因,这些基因分布在1A/1B/1D、2A/2B/2D、6A/6B/6D、7A/7B/7D染色体上,可分为Group A和Group B两大类,Group A包含TaGBSS、 TaSSⅠ、 TaSSⅡ三个亚家族,所编码的蛋白均具有motif1~motif10,且motif排列顺序一致;Group B包含 TaSSⅢ、 TaSSⅣ两个亚家族,所编码的蛋白都缺少motif9和motif10,另外 TaSSⅢ亚家族还缺少motif8。与玉米、水稻、高粱、拟南芥不同,小麦淀粉合酶基因没有 TaSSⅤ亚家族。同一亚家族内不同基因具有明显的表达差异,其中, TaGBSSⅠ、 TaSSⅡa和 TaSSⅢa在胚乳中特异表达;小麦相同部分同源群内的淀粉合酶基因间在不同组织和不同发育时期也存在表达差异, TaSSⅡa-B和 TaSSⅡa-D在授粉后20 d和30 d的胚乳中表达量比 TaSSⅡa-A高。差异表达的淀粉合酶基因启动子中的胚乳特异表达元件(RY-element、AACA-motif和ACGTOSGLUB1)存在类型和数量差异。

来源:2022年第8期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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