麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2022年第10期:大麦气孔发育相关基因HvSPCH的克隆及初步功能分析

发布日期:

作者:次尔甲玛,王宏鹏,苟筱颖,佟可心,郭瑞超,王俊斌,曹高燚,包曙光,谢晓东,陈小强

单位:天津农学院农学与资源环境学院,天津 300384

关键词:大麦,气孔发育,SPCH转录因子,基因克隆,

基金:国家级大学生创新创业训练计划项目(202010061003);天津市科技计划项目(21ZYCGSN00130);天津市研究生科研创新项目(2020YJSS131);国家级大学生创新创业训练计划项目(202110061037);国家自然科学基金青年基金项目(31801446)

气孔是植物与外界进行气体交换的通道,对植物的生长发育至关重要。SPCH转录因子与气孔的发育关系密切,为揭示其在大麦中的功能,以大麦G1614为材料,利用PCR方法克隆大麦SPCH(HvSPCH)基因后,进行生物信息学分析,并对该基因在干旱胁迫条件下的表达模式进行分析。结果表明,HvSPCH基因编码区长为1 098 bp,可编码365个氨基酸,相对分子量为90 504.73 Da,理论等电点为4.96,为疏水的、不稳定的碱性蛋白质。氨基酸序列分析表明,HvSPCH蛋白的氨基酸序列不含有跨膜结构域和信号肽,含有40个磷酸化位点和27个糖基化位点。二级结构分析表明,HvSPCH蛋白包含35.62%的α-螺旋、8.77%的延长链、2.47%的β-转角和53.13%的无规则卷曲。系统进化分析表明,大麦HvSPCH蛋白与水稻、野生二粒小麦、二穗短柄草的SPCH蛋白亲缘关系较近。qRT-PCR分析结果表明,干旱处理4 h和12 h时,HvSPCH基因的相对表达量显著升高,说明其有可能参与大麦的干旱逆境响应过程。

来源:2022年第10期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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