麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2022年第10期:春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析

发布日期:

作者:严勇亮,张恒,张金波,时晓磊,耿洪伟,肖菁,路子峰,倪中福,丛花

单位:1. 中国农业大学农学院,北京 100193;2. 新疆农业科学院农作物品种资源研究所,新疆乌鲁木齐 830091;3. 新疆农业科学院国际科技合作交流处,新疆乌鲁木齐 830091;4. 新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室,新疆乌鲁木齐 830052

关键词:小麦,籽粒性状,全基因组关联分析,SNP,候选基因,

基金:国家自然科学基金项目(31660389,U1403185); 乌鲁木齐市科学技术计划项目(Z161210002); 新疆维吾尔自治区农牧业骨干人才培养项目

为挖掘控制春小麦主要籽粒性状的关联SNP及候选基因,以国外引进品种、新疆地方品种、新疆自育品种共298份春小麦品种为材料,利用小麦55K SNP芯片,对5个环境下小麦千粒重、粒长、粒宽3个主要籽粒性状进行基于Q+K混合线性模型(mixed linear model,MLM)的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。结果表明,供试小麦品种的3个主要籽粒性状在5个环境下的变异系数为3.89%~19.77%,其中粒宽的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大。不同环境中,新疆育成品种的3个主要籽粒性状的平均值均最高,而新疆地方品种的3个籽粒性状的平均值均最低。GWAS结果表明,共检测到84个与小麦主要籽粒性状显著关联的稳定SNP位点,它们分布在小麦的21条染色体上,单个SNP位点可解释3.74%~11.18%的表型变异。在1B、2B、3B、4B、5A、5D染色体上检测到6个同时关联多个籽粒性状的稳定位点。对84个SNP位点进行候选基因筛选,筛选到6个可能与小麦主要籽粒性状相关的候选基因,可作为小麦籽粒研究的重要基因。

来源:2022年第10期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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