麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2021年第10期:基于GBS技术构建四倍体杂交冰草超高密度遗传连锁图谱

发布日期:

作者:杨东升,于卓,于肖夏,李佳奇,李景伟,吴国芳,卢倩倩

单位:内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特 010019

关键词:四倍体杂交冰草,F2群体,SNP标记开发,超高密度遗传图谱,

基金:国家自然科学基金项目(31660681)

冰草是优良的牧草,也是小麦等麦类作物抗逆遗传改良的重要基因库。构建冰草超高密度遗传连锁图谱,有利于冰草的标记辅助育种和遗传分析。本研究利用基因分型测序(GBS)技术,对四倍体杂交冰草F2分离群体的115个单株及其亲本蒙古冰草和航道冰草进行高通量SNP基因分型,经测序获得了超过584 Gb的数据,SNP鉴定以及完整度和偏分离过滤后,最终得到了5 035个高质量的SNP标记;采用Join Map 4.0作图软件构建四倍体冰草超高密度遗传连锁图谱,该遗传图谱包括14个连锁群,各连锁群的长度范围在68.959~280.309 cM之间,平均长度为153.473 cM,覆盖的基因组总长度为  2 148.621 cM,标记间的平均距离为0.427 cM。该图谱是目前冰草中分子标记数目最多、密度最高的遗传连锁图谱,为进一步开展冰草品质、抗性等重要性状的QTL定位、图位克隆及分子标记辅助育种研究等奠定了基础。

来源:2021年第10期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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