麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2021年第12期:小麦miRNA启动子的基因组分析

发布日期:

作者:任治鹏,王多佳,田宇,娄贵成,李畅,王政委,张达,苍晶

单位:东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨 150030

关键词:小麦,miRNA,启动子,顺式作用元件,基因组,

基金:国家自然科学基金项目(31971831)

MicroRNA(miRNA)是一类非编码RNA,与植物的生长发育及胁迫响应密切相关。为给小麦miRNA的转录调控以及新miRNA的预测提供参考依据,本研究通过小麦miRNA基因定位、启动子预测以及顺式作用元件鉴定等方法对小麦miRNA启动子进行了基因组分析,结果表明,小麦基因组中有105个pre-miRNA位于150个基因座上,大部分为单拷贝。148个miRNA基因座具有潜在启动子区域,其中115个miRNA基因至少能够预测到一个启动子。保守性及基因位置不同的miRNA的启动子转录起始位点(TSS)分布也稍有不同,但大多数位于上游序列近端区域。对miRNA基因TSS上游序列的顺式作用元件分析发现,miRNA启动子区域存在与胁迫响应相关的基序,且小麦中存在3个miRNA启动子特异性基序。61.4%的小麦miRNA启动子区域有CpG岛分布。

来源:2021年第12期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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