麦类作物学报

作者：李文静，赵新颖，纪萌琦，郭鑫，郭红，邓志英，田纪春

单位：山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室/小麦品质育种研究室/山东小麦玉米周年高产高效生产协同创新中心,山东泰安 271018

关键词：小麦,幼穗,近等基因系,二棱期,RNA-Seq,

基金：山东省重点研发计划项目(2017GNC10102)；国家自然科学基金项目(31301315); 山东省高等学校科技计划项目(J17KA148)

抽穗期是与小麦适应性直接相关的一个很重要的性状，直接或间接影响小麦的产量和抗性。为明确控制抽穗期的关键表达基因，以抽穗期分别为196 d和184 d的小麦近等基因系Y57和96-2为材料，对其二棱期幼穗分别构建转录组测序文库，利用Illumina HiSeq 2500平台进行RNA-seq测序；将获得的clean read与中国春参考序列比对，得到unique read，采用FPKM法计算基因表达量，对差异表达基因进行功能注释、GO和COG功能分类以及KEGG通路分析。结果表明，供试材料经过测序获得质量不低于30的碱基比例(Q30)均高于85.5%；Y57和96-2分别有60 246 194和60 963 580条clean read，其中63.11%和69.51%能与参考基因组序列匹配。共筛选到395个差异表达基因，有382个基因得到功能注释；有298个基因获得GO功能注释，主要涉及细胞组分、结合、细胞反应和代谢过程；COG注释的基因主要涉及一般功能、信号转导机制和转录；KEGG功能注释分析发现，显著富集在光合作用-天线蛋白通路上的基因均上调表达。编码丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2A的基因在Y57中几乎不表达，而在96-2中表达量较高。进一步分析发现，多个与生长发育、抽穗开花相关的转录因子在两个材料中的表达差异显著。此结果可为深入研究抽穗期相关基因和穗发育调控机制奠定基础。

来源：2019年第1期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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