麦类作物学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:61-1359/S

国际刊号:1009-1041

麦类作物学报杂志2019年第11期:青稞叶绿体基因RNA编辑位点的预测、鉴定与比较分析

发布日期:

作者:昌西,裴悦,胡凡,任苗苗,王彤,聂小军

单位:(1.西藏农牧学院植物科学与技术学院,西藏林芝 860000; 2.西北农林科技大学农学院,陕西杨凌 712100)

关键词:青稞,叶绿体,RNA编辑,RT-PCR,

基金:西部提升计划“作物学学科建设项目”(XBTSZWXK-2015);中央财政支持地方高校“作物学学科建设项目”(ZYCZZWXK-2016)

为了阐明青稞叶绿体基因组RNA编辑位点的组成与特性,首先利用生物信息工具对青稞叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测,结果发现了35个分布于15个基因的编辑位点,所有编辑均为C到U的转换,其中基因ndhB包含的编辑位点数量最多,达9个,这与其他麦类作物相似;进一步利用RT-PCR结合克隆测序,对预测的35个位点进行了实验验证,发现18个编辑位点被证实发生了C到U的编辑;对编辑前后编码蛋白质的结构进行了比较分析,发现RNA编辑引起了编码蛋白的结构变化,暗示RNA编辑可以造成编码蛋白功能的改变。最后,将青稞叶绿体基因RNA编辑位点与栽培大麦、野生大麦的叶绿体RNA编辑位点进行了比较,发现青稞与栽培大麦的RNA编辑组成完全一样,而野生大麦缺失了ndhA-563位点,初步印证了大麦的起源进化关系。

来源:2019年第11期

《麦类作物学报》期刊编辑部

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